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李南终于见到已经十三岁的张无忌，因为练习了两派混合九阳内功，在加上张三丰和其他人使用内力为他疗伤，所以他还未毙命，但是身体已经被寒毒折磨的虚弱不堪，看上去小小瘦瘦的，完全不像他这个年纪的孩子。张无忌在父母死后，就将和他最熟悉的李南当成亲人，如今见到为他寻医问药的李南回来后兴奋不已，连忙扑进他的怀里，眼中流下泪来，李南将九阳真经全本的第一册心法细细的讲解给他，只盼着为时不晚，还能救得他的性命。
张三丰召集所有徒弟门人共聚真武大殿，开口说道：“如今闲云取得九阳真经全本，虽说耽误了很久，被寒毒折磨多年的无忌以后学习不了高深的武功，但是总算是保住了性命，况且不能习武也未尝不是一件幸事，我今年已经一百多岁了，没有精力再去管武林中的是是非非，所以我宣布，武当派第二任掌门就由李闲云担任。”
武当诸子虽然各有各的性情，但是师兄弟之间的关系非常的和谐，如今听得李南被师傅任命为掌门，大家纷纷恭喜祝贺，李南虽然极力推脱，但是师命难违还是接下了这个重任。
李南跪在张三丰面前说道：“多谢师傅对我的信任，我必谨守门规，惩恶扬善，继续努力发扬光大武当派。”
武当派没有举办继任大典之类的仪式，只是随后派人通知了其他门派，江湖中人也知道了武当派掌门人的变动，随后峨眉少林等派也派人送来了贺礼。
李南当上掌门人之后并没有什么太大的动作，白天依旧专心修炼九阳神功，夜晚偶尔会下山教导周芷若的武功，五六年间，他每年都会去几次川藏，检视一下朱武二人的扩军进展，顺道也可以安慰一下寂寞的雪岭双姝。
时间过的很快，忽忽数年时间，周芷若也长成了一个俏佳人，该教的武功李南已经都教给了她，周芷若也作为李南的代表常驻黑巾军中，这几年朱长龄显露出了他作为宰相的能力，他和武烈两人将黑巾军管理的井井有条，两地的官府和地方势力都被渗透的七七八八了，只待时机成熟就可以高举义旗。
如今蒙元朝廷日益衰败，中华大地上大大小小的义军层出不穷，元朝军队不断的征剿，可是扑灭了一股叛军又出现了两股，汉人们已经忍受不了他们的残暴统治，长期积累的怒火不断的宣泄出来。
朝堂****，江湖中也不安稳，趁着乱世，明教中人在穷苦百姓中大肆传教，带着这些被洗脑的贫民百姓攻打州府，一时间声威竟然超越了其他各门各派，各大门派见到明教现世，自然不能容忍，纷纷派人对付他们。
峨嵋派灭绝师太牢记着师兄孤鸿子被明教杨逍气死的仇，谢逊杀死亲哥哥全家的恨，所以每年都有大量峨眉弟子下山历练，她们的主要目标就是明教中人，双方这几年来互相都有死伤。
少林派的空见大师死在谢逊手上，天鹰教殷素素杀死了龙门镖局满门，这两笔帐也算在了明教名下，少林弟子众多，每当遇到明教中人的时候也不会手下留情。崆峒派因为镇派之宝七伤拳谱被盗的旧怨，华山派因为白恒被杀之仇，江湖上每日间血雨腥风一片纷乱。
周芷若接掌了李南暗中打下的根基，统领着七派九帮共计十六家小门派，如今正在向甘肃和湖南湖北侵袭，她的父亲是因为明教的常遇春而死，所以明教和蒙元朝廷都上了她心中的黑名单，遇到了那些明教纠集的小股义军，黑巾军自然全部将之吞灭，周芷若的手上也沾染了不少明教中人的鲜血。
江湖上大乱，明教和六大派的仇怨渐深，有鉴于此，峨眉派灭绝师太发信给了其他五派掌门，号召大家尽起派中精锐前往昆仑山光明顶，一举剿灭明教。
李南留下宋远桥和殷梨亭留守武当山照顾残废的俞岱岩、张无忌和张三丰，带着俞莲舟、张松溪、莫声谷、宋青书来到了峨嵋派信中留下的集合地。
武当派虽说换了李南作为掌门，但是门派实力依旧是数一数二的，所以众人到达的时候，灭绝师太得到消息后，带着众弟子出来迎接。
李南还是第一次见到这位峨嵋派的掌门，她年纪大概有五十多岁，本来的长相应该还算不错，可是却被两条斜斜向下的眉毛破坏了，看起来倒像是吊死鬼，身穿一袭白色道袍，腰间悬挂着一柄奇长的宝剑。灭绝师太的身后跟着她的几位弟子，李南发现楚月居然站在左手边，右手边是丁敏君，古人尊左，由此可见楚月如今已经成为了峨嵋派的二号人物。
现在李南已经是一派掌门，即使面对灭绝师太也是拱手施礼，郑重说道：“武当派李闲云见过峨眉掌门。”
灭绝师太对武当派没有什么仇怨，而且因为弟子纪晓芙的事情还对武当有所愧疚，所以一向不苟言笑的灭绝居然微笑答道：“这次峨嵋派号召各派剿灭明教，武当派李掌门能为了武林苍生着想，应邀亲自前来，贫尼真是喜出望外。”
这些年中，经常下山游历的李南早已经见过不少明教的恶事，这些人也是利用宗教为百姓洗脑，欺哄乡民杀男霸女，干出了不少恶事，因此李南的话中带着浓浓的杀意，“明教中人行事狠辣作恶多端，哪一个手中没有几个无辜之人的性命，实在是剿之不冤，灭之不枉。”
听罢李南的言论，灭绝师太赞同道：“李掌门所言甚是，既然我们人都到齐了，那就前往昆仑山吧，路上大家再慢慢聊如何？”
峨嵋派弟子在前，武当派弟子在后，两位掌门居中，这支队伍一路向西方的昆仑山行去，明教教众早已经得到了六派前来的消息，明教的五行旗经常会埋伏在暗处狙杀诸人，但是有身怀九阳神功的李南和手持倚天剑的灭绝师太在此，那真是来几个死几个，很快明教就改变了策略，五行旗转去攻击其他各派，明教中其他武功高超的人则来对付这两派。