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两人为了达成的目标，与宝可梦一奋斗。
对战开拓区篇结束后，遥为了独挑战城地区的华丽大赛和智告，胜到了橙华馆。
智受到了茂的鼓励，独带着皮卡丘和偷跟的的长尾怪往神奥地区开始的挑战。
智、和刚3人的旅非一帆风顺，他们在途上遇上多人和，智曾惨败给真司，也曾在2宝可梦华丽大赛的一审查惨遭淘汰出局。
经辛苦，终于集齐5枚缎带徽章，在神奥华丽大型庆典示出，一参便晋级决赛，在决赛以稍微差距输给友望；智也集齐8枚徽章，他在神奥联盟有得开始，在1战打败尚志，2战打败某女人，3战(16)打败考，8更打败真司，可是他无法势如破竹而在准决赛惨败给达克多，在4出局。
神奥旅随着神奥联盟结束而来到尾声，智刚曾邀请一往关地区，卷卷耳邀请而不能来，当的落，智在码头上和以后一击掌，与皮卡丘刚乘船返关地区。
出后，智和刚到关地区，在往真镇深灰市的分叉口，智和刚握互祝福对方后告。
智和皮卡丘终于见真镇，他们跑进返真镇的后一段，神奥之旅划上句号。