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这简直就是天灾加人祸，陈星的控制力在消失，他辛苦摆出的“巨石阵”眼看就要毁于一旦。然而，在人类骂声的背后，人类的金字塔高层却个个希望植入能量豆芯片，他们并没有出声，都在静观局势。
陈星认清，想要稳住人类，就要让金字塔顶层的富人和社会精英们获得能量豆，利用他们的财富和影响力，镇压和奴役人类，让人类猴群继续制造陈星需要两样东西：大型的宇宙飞船和大量的能量豆。
陈星开始大量复制能量豆，他对这项技术控制得非常严密，绝大部分的工作都由机器人来做，只有机器人智慧还达不到的，才交给人类，他不能让人类掌握全部的生产能量豆的科技。
一旦开启了新科技的大门后，就会在这个方向的竞争上越走越远。陈星终于开始给人类“精英”们安装能量豆了，不久，已经有一大批“精英”装上了梦寐以求的能量豆，成了“改良人”，这些脑中已经安装了能量豆的“社会精英”尝到了甜头，他们控制、打压着原生人。然而，这群“改良人”需要消耗大量的资源，这让本来已经满负荷运行的地球更加不堪重负，为了满足对资源的欲望，“改良人”们愈发暴力。于是，改良人与原生人之间的冲突不可避免地爆发了。风口浪尖上，Jimmy摇身一变，成了金字塔下层革命者追捧的对象，在落寞的金字塔上层旧势力的推崇下，他如愿以偿地坐上了“头领”交椅，之后他在世界各地组织斗争小组，不久，陈星在美国、巴西、澳大利亚、俄罗斯、英国、肯尼亚的宇宙飞船工厂都遭到了破坏。
“改良人”们坐不住了，他们不希望看到自己的财富和地位发生动摇，更重要的是，安装了能量豆的他们，对于前往外星球去繁殖的欲望更强了，他们红了眼，要用靠武力镇压底层人类的反抗，他们掌握着灭绝人类的机器人大军。而逐渐有了更高智慧的机器人军团们，也在静待时机，等待“原生人”与“改良人”之间的争斗，他们鹬蚌相争渔翁得利。
陈星却在挣扎，陈星出身于人类金字塔底层，使得他和那些获得能量豆的人类高层不同，他长期以来一直与能量豆共同成长着，他那人性的光辉并没有磨灭。而那些金字塔顶层的人，被轻而易举被能量豆彻底控制了。
陈星找到了郑非人和乔帮主，这两位垂垂老矣的老人，人类最高的智慧者，已经走到了肉体存活的极限。陈星跟他们从头到尾讲了自己被宇宙寄生虫能量豆寄生的故事，希望他能制止Jimmy，他说：“我是被宇宙寄生虫寄生了，才有了超越人类的智慧，这算是一种互惠互利吧。宇宙中这种互惠互利的事情很多。地球上处于金字塔顶层的人，也是寄生在底层人类身上的，但是你们超越普通人的大脑，又为底层的人类解决了难题、描绘了梦想。”
郑非人说：“你误解了寄生和共生的关系，寄生最终导致寄主的灭亡，而共生是两者可以和谐相处。就像人类肠胃里的细菌，可以帮助消化。人类顶层和底层是共生的关系，而不是寄生。”
陈星说：“宇宙中没有共生，共生只是寄生程度的不同。智慧高的生物为了争夺资源最终会灭绝智慧低的生物，就像你们人类灭绝了地球上其他生物一样。如今人类暴动一触即发，现在的人类已经掌握太多的科技，再发生暴动将是灾难性的。Jimmy是什么样的人你们也知道，他会把人类带向深渊。”
“你太聪明了，智慧高过我们，这让我们不安。但是我还要请你看在我们这么多年交情的份上，认真回答我一个问题。”郑非人盯着陈星说道，他从来没有这样过。“地球的是不是没有希望了？”他问道。
陈星长叹一口气，说道：“是的，星际天气预报已经发出了光速信息，只是地球人根本不明白这信息代表着什么。流星雨带将要吞噬太阳系几大行星，其中就包括地球。我们非走不可。”
老人闭上了眼睛，摇摇头，如今的Jimmy已经不受老人控制了。见状，陈星也摇摇头，安装能量豆的那些“改良人”，也已经不受陈星控制了。属于陈星和老人的时代，已经过去了，两位老人临终托孤：“无论你是不是人类，请你务必将人类的火种延续下去。”他们把最后的秘密告诉了陈星，就与世长辞了。。
老人的秘密是南极附近的一座小岛，那是一座连卫星也无法发现的小岛，一个真正的世外桃源。那是生前追随老人的忠诚下属们建设的一座岛屿，名字叫复兴岛，那里的人们正等待着陈星和家人的到来。陈星带着家人们前往了那里，他们将在那里开心地度过地球上最后的美好时光。
“改良人”们出动了，他们已经被能量豆洗脑了。他们高举陈星的大旗，宣传只有他才是救世主，让人类怀念陈星带领人类度过难关的岁月，这些门徒式的“跟随者”们说：“从古至今，人类历史上某个时期科技的巨大突破，也曾收到过外星文明的影响。如今，人类文明在走向机械化、智能化，与祖先相比，人类的衣食住行已经离不开科技，我们的衣服可以储存信息、帮我们举起重物；我们吃的是真菌发酵后的蛋白质、水合物；我们住在沙漠边缘的绿道上；我们的交通工具让我们再也感觉不到地球的广袤……如今人类的一切都是建立在科技的基础上的，然而人类的大脑根本无法存储这么多科技信息，也无法计算这庞大的数据库。如今，离开机器人、离开科技人类已经寸步难行。但是，庞大的科技哲学逻辑运算是人类文明的极限，人类根本无法靠自身解决内部问题，人类一直在宇宙中寻找能够替代地球的星球，却一直没有这能力。人类靠自然进化已经来不及了，太阳系留给人类的好日子到头了，星际天气预报已经发出警告，流星雨将要在1250天后降临地球，如果只靠人类智慧，将和地球一起毁灭。”